アカウント作成  |   ログイン

View All »Matching Part Numbers


カートは空です
         

ThorImage®LS 顕微鏡用ソフトウェア


  • Imaging Software to Control our Multiphoton, Confocal, and Hyperspectral Microscopes
  • Customizable Interface with Diverse Functionality

ThorImageLS is used to control all of our microscope systems.

See Overview Tab Below for Image Information

See Overview Tab Below for Image Details

Related Items


Please Wait

ThorImage®LSの概要

ThorImage®LSイメージングソフトウェア

ThorImageLSソフトウェアは当社のBergamo®多光子顕微鏡、Cerna®ハイパースペクトルシステム、共焦点顕微鏡、およびその他の補助機器の動作を制御してデータセットの取得および解析を行います。当社で開発されたバージョン3.1には、ホログラフィックオプトジェネティクス、生体深部スキャン、広域タイリング、高速イメージング、マルチモ-ダル画像の取得といった様々なイメージング手法を実行するための機能がございます。ThorImageLSの機能の詳細については、下の画像または上のタブをクリックしてご覧ください。

WorkspaceCapabilitiesThorSyncInteroperabilityOpen SourceSpecificationsPublicationsImage GalleryWhat's New

In 

 このページの上部の写真ではThorImageLSを使用して取得可能な画像の一部をご紹介しています。

  • 上段左:海馬細胞内のニューロフィラメント(緑)、グリア細胞(赤)、DAPI染色した核 (青)のマルチチャンネル共焦点イメージ
  • 下段左:GCaMP6f(緑)およびC1V1(赤)を共発現した細胞100個への光同時刺激(画像ご提供:Lloyd Russell, Dr. Adam Packer, and Prof. Michael Häusser, University College London, United Kingdom)
  • 上段右:thy1-YFP発現マウスの歯状回の2光子3D画像スタック(画像ご提供:2017 Imaging Structure and Function in the Nervous System Course at Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY)
  • 下段右:コヒーレント反ストークスラマン散乱(CARS、赤)、第2高調波発生(SHG、緑および紫)、および和周波発生(SFG、青)によるニワトリ心臓の画像

ThorImage®LSソフトウェアの作業スペース

ThorImageLSを用いると、その直観的で多機能なワークフローにより、画像の取得および解析プロセスを効率化することができます。コントロールパネルは重要な機能にすぐにアクセスできるように設計されており、実験のセットアップを素早く行うことができます。パネルのレイアウトは全てカスタマイズ可能で、様々なユーザやイメージング手法(modality)に対応することができます。全てのソフトウェア機能へのアクセスが容易な、操作性に優れた自己完結型のパッケージ型ソフトウェアです。

作業スペースの詳細は下図のハイライトされた領域をクリックするとご覧いただけます。

ThorImageLS Application WorkspaceMulti-Modality SupportMulti-Modality SupportAutomated Image CaptureIntuitive Data VisualizationThorImageLS workspace customizationThorImageLS workspace customizationROI ToolsSoftware TechniquesAutomated Image CaptureROI ToolsMulti-Modality SupportIntuitive Data VisualizationROI ToolsROI ToolsIntuitive Data Visualization

Close

 

ThorImage®LSはマルチモーダル画像に対応する総合的なソフトウェアパッケージです:

  • 各イメージング手法に適した作業スペースにカスタマイズ可能
  • イメージング手法の切り替えを高速化して作業時間の短縮化
  • ワイドフィールド画像と共に設定したレーザ走査画像を同時に取得
  • 画像と試料の動きとの相関を見るために、顕微鏡の画像データに同期した外部カメラのデータを取得

ThorImageLSで試料を容易にイメージングする方法についての詳細は、「性能」および「 ThorSync™」タブをご覧ください。

Close

 

プログラムルーチンによる画像取得が可能です:

  • ドラッグ&ドロップによるスクリプトインターフェイスを使用してコマンドシーケンスを作成
  • ThorImageLSからデータのエクスポートやサードパーティによるスクリプトの実行が直接可能
  • Fiji/ImageJマクロやMATLABスクリプトの実行
  • オープンソースSDKによりお手持ちのデバイス用プラグインのコード作成が可能
  • オープンソースコードにより、フルカスタマイズおよび外部処理との統合が可能

詳細については「インターオペラビリティ」タブおよび「オープンソース」タブをご覧ください:

Close

 

データ取得後の可視化やエクスポートが容易です:

  • X-Y、YZ、X-Z面での2Dスライス画像の同時走査
  • 3Dでのレンダリングおよび画像回転により試料全体の可視化と非直交性の特定
  • イメージセットはVR環境に対応
  • イメージセットとデータは一般的なファイルフォーマットで保存
  • 4D、3D、2D、ライン、ポリライン、ポイントでのデータ取得

詳細については「性能」 および「インターオペラビリティ」タブをご覧ください。

Close

 

ThorImageLSにはストリームラインデータを取得しやすいインターフェイスがあります:

  • 直観的なデザインによりハードウェア制御素子に容易にアクセス可能
  • ユーザやイメージング手法に応じてカスタマイズできる複数の設定欄のレイアウト
  • ワークステーションの共有時に複数ユーザの設定を保存

ThorImageLSの動作の様子は「概要」 および「性能」タブの動画でご覧いただけます。

Close

 

ThorImageLSの多機能性により、要求条件の多い実験に対しても調整が容易です:

  • 光刺激:マルチポイント同時、全視野、およびシーケンスマルチポイント
  • 広域イメージをモザイク状にタイリング
  • リアルタイムでの関心領域のマスキング、解析および画像修正
  • Z-スタックおよびボリュームデータを高速で取得
  • マルチモーダル画像
  • レーザーパワーのランピングおよび迅速な波長切り替え
  • 外部のハードウェアおよびソフトウェアによる制御に適したイメージング

さらに詳しい情報については「性能」および 「ThorSync」タブをご覧ください。

Close

 

1つまたは複数の関心領域(ROI)を選択し、リアルタイムでの計算と画像取得を同時に実行できます:

  • 関心領域を様々な形状で選択可能
  • 強度の時間変化
  • 強度の平均値、最小値および最大値
  • 標準偏差
  • 数値演算

その他のThorImageLSの性能については「性能」タブをご覧ください。

ThorImage®LSの性能

ThorImageLSは様々な機能を一つに統合化したイメージングソフトウェアで、以下ではそのいくつかの機能をご紹介しています。 ソフトウェアのすべての機能は「仕様」タブにリスト表示しております

 

Quick Links
Data-Dense Acquisitions
5D Visualization
Modalities Supported
Sequential Imaging
Images Coordinated with Experimentation
Multi-ROI Photoactivation and Masking
High-Speed Video
Deep Physiological Scans
Simultaneous Image Processing
Real-Time Analysis and Image Correction
Large-Area Mosaic Tiling

高密度データの取得

 

DIC and Confocal Fluorescence Kidney Cells
Click to Enlarge

腎臓細胞の共焦点蛍光およびDICによる画像
Fast Switching
Click to Enlarge
TIBERIUS® Ti:サファイアレーザを7 fpsで750 nmと835 nmの波長切り換えを行って取得した合成画像(画像提供:Lynne Holtzclaw, NICHD Microscopy and Imaging Core, National Institutes of Health, Bethesda, MD)。

5D可視化

ThorImageLSは完備されたソフトウェアパッケージとしてご提供しており、すべてのXYZCTデータセットを取得できます。X、Y、Z方向の3Dボリューム画像を取得し、それを経時的に追跡して動的な事象を調べることができます。同じソフトウェアの中で、複数の蛍光色素画像や複数のイメージング手法による画像を重ねることで、5D情報をそれぞれ独立に追加することができます。セットアップおよび画像取得は、データ量が多い場合でもシンプルかつ直観的に行えるように設計されています。

サポートされているイメージング手法

顕微鏡での複数のイメージング手法を利用した画像取得を簡素化するために、ThorImageLSは以下のイメージング手法に対応しています。

  • レーザ走査(ガルバノ-ガルバノおよびガルバノ-レゾナント)
    • 蛍光
    • Dodt
    • 第2高調波発生(SHG)/2光子
    • 第3高調波発生(THG)/3光子
  • ワイドフィールド
    • 蛍光
    • 明視野
    • ハイパースペクトル
    • 微分干渉顕微鏡(DIC)
    • Dodt
    • 暗視野
    • 位相差

1つのソフトウェアパッケージでマルチモーダル画像を取得でき、複数のソフトウェアアプリケーションを切り換える必要がありません。レーザ走査イメージとワイドフィールドイメージを同時に取得可能です。それに加えてThorSync™を使用すれば、外部カメラのデータと顕微鏡の画像データを同期させて、画像の特徴と試料の動きとの相関を見ることもできます。

連続画像取得

ThorImageLSは、顕微鏡とレーザ光源の動作のタイミングを正確に調整して、標準モードまたは高速モードで連続して画像取得ができます。当社のマルチチャンネル共焦点システムを用いると、登録された画像や画像スタックを取得するために波長を簡単に切り替えることができます。また、当社のTIBERIUS®フェムト秒Ti:サファイアレーザを用いるとマルチチャンネルによる高速な多光子イメージングが可能になり、信号対雑音比(SNR)が高くチャンネル間クロストークの小さい画像が得られます(右図がその一例です)。

 

実験と連携した画像

 

In Vivo 3D Mouse Brain Stack
Click to Enlarge

マウスの1次体性感覚野の厚さ1.2 mmのin vivo3D画像。thy1-YFP発現マウス(H line)のニューロンを黄色、スルホローダミン101によって染色した血管を赤で示しています(画像ご提供:Dr. Hajime Hirase, Katsuya Ozawa, and YOU. H, RIKEN Brain Institute, Wako, Japan)。
Photostimulation with Spatial Light Modulator
Click to Enlarge

GCaMP6f(緑)およびC1V1(赤)を共発現した細胞100個への光同時刺激(画像ご提供:Lloyd Russell, Dr. Adam Packer, and Prof. Michael Häusser, University College London, United Kingdom)。

複数の関心領域(ROI)の光活性化およびマスキング

光活性化
オプトジェネティクスのための光活性化やプロテインのアンケージングは、ThorImageLSを用いると使用機器に合わせて様々な方法で行うことができます。

Bergamo®IIシステムに対応する当社の空間変調モジュールはThorImageLSで直接制御でき、数百の関心領域(ROI)を同時に、個別に、またはグループごとに活性化することができます。右の画像は当社のソフトウェアを用いて顕微鏡の視野内にある100個のニューロンを特定し、それらに同時刺激を与えた様子です。

ガルバノ-ガルバノスキャナを使用して、何千もの関心領域を順次連続的に刺激することもできます。細胞全体を確実に刺激できるように、ガルバノ走査パターンと関心領域のタイプを指定できます。この活性化は画像取得と正確に同期しており、高感度なPMTの寿命を延ばすことができます。

全視野刺激を行う場合は、LEDまたはレーザ光源のどちらかを使用します。刺激は画像取得の前または後、あるいは各フレーム間でも行うことができます。

マスキング
ガルバノ-レゾナントスキャナ方式のレーザ走査顕微鏡の場合には、位置ごとのレーザ光の滞在時間が一様でなくなり、特に走査領域の末端においてそれが顕著に現れます。ThorImageLSはポッケルスセルを制御して(Bergamo IIシステムで使用可能)エッジの消去および関心領域の高速マスキングを行うことで、領域内のレーザ励起の均一性を向上させるとともに、領域外の不要な露光を防止します。関心領域はライブ画像内を単にドラッグ&ドロップするだけで指定できます。

高速ビデオ

画像セットは最大400 fpsで取得できますが、保存可能な容量は対応するハードドライブのサイズよって制限されます。ボリューム画像取得時は、顕微鏡のピエゾによる高速なZ方向移動量とデータ取得を同期させ、ユーザ定義のステップサイズで正確に走査することができます。データの取得途中でも、そのビデオフレームレートでそれまでに取得された画像セットあるいはストリーミングの画像セットに対して、関心領域のリアルタイム解析を行うことができます。そのため高感度なin vivoの実験における停止時間を短縮できます。

生体深部スキャン

ThorImageLSは補助的なハードウェアの動作を調整して、深部の高速3D画像スタックをより効率的に取得できます。移動距離の長いステッピングモータや高精度のピエゾモータを用いて、ユーザが定めたステップサイズでZ軸に沿って広範囲に移動させることができます。組織の深さに依存する光散乱の影響は、深さに応じてレーザ光のパワーを変化させて補正することができ、走査中の信号応答を均一化できます。可変ビームエキスパンダが組み込まれたBergamo IIシステムでは、ThorImageLSでレーザのビーム径を直接制御できます。それにより、ビーム径を顕微鏡の対物レンズより大きくして表面の分解能を高くしたり、対物レンズよりも小さくして試料のより深部まで光が届くようにしたりできます。

 

画像の同時処理

 

Large-Area Mosaic Tiled Image of a Rat Retina
Click to View Full-Resolution Image

DAPI、イソレクチン、GFAPで染色したラットの網膜のスティッチング処理された共焦点蛍光画像。重ねて表示されている白い線はタイリングされた個々の画像を示しています(画像ご提供:Jennifer Kielczewski, National Eye Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD)。

関心領域のリアルタイムでの解析および画像修正

画像取得と同時にリアルタイムで演算処理ができるように、画像の取得前または取得中でも関心領域の選択ができます。関心領域は様々な形状で選択でき、光活性化においては離れた集団をグループ化することもできます。関心領域について以下の計算が可能です:

  • 強度の時間変化
  • 強度の平均値、最小値および最大値
  • 標準偏差
  • 数値演算
    • dF/F
    • レシオメトリックイメージング

広域のモザイクタイリング

関心領域を観察するのに1回の画像走査では十分な分解能が得られない場合は、試料面を連続したタイルのように画像化していくことができます。それらをソフトウェアでスティッチング(stitch、縫合)し、1枚の高分解能な合成画像にします。タイルの位置、サイズ、およびタイルのオーバーラップの設定、さらに試料と対物レンズとの非直交を修正するためのチルト調整が可能です。この機能は、時系列の画像セットと3D画像スタックの両方にも対応しています。

ThorSync
Click for Details

係留されたショウジョウバエの飛行をThorSyncで記録し、視覚刺激に対して素早く動く様子を観察(画像ご提供:Dr. Michael Dickinson and Dr. Ivo Ros from the California Institute of Technology, Pasadena, CA)。

ThorSync™

ThorSyncは、デジタル信号とアナログ信号を最大2 MHzの速度でモニタし保存します。このソフトウェアアドオンはThorImage®LSと連携して動作するように設計されており、顕微鏡のデータ取得と補助的なハードウェアを連携させその処理プロセスを同期させます。ThorImageLS同様に、ThorSyncのアプリケーションコードもご提供しているので、ソフトウェアのフルカスタマイズが可能です。

このソフトウェアパッケージは、光励起/光刺激などの実験を開始したり調整したりするために、任意のデジタル波形を出力します。デジタル信号やアナログ信号のサンプリングには同じベースクロックが使われており、得られたデータはPCのハードドライブに保存されます。データサンプリング用に、アナログ入力チャンネル(AI)が16、デジタルTTL入力チャンネル(DI)が32あります。アナログ信号は+/-10Vに対して16 bitの分解能でサンプリングできます。光とシャッタの制御用デジタル出力信号(DO)のリフレッシュレートは最大2 MHzです。このソフトウェアは、顕微鏡のメインPCに組み込まれたPCIeベースのDAQを利用します。

ThorSyncは、データ取得中および取得後に、可視化された詳細な波形情報を保存します。ロールオーバ統計によりすべての信号のリアルタイム情報が提供され、ユーザが各波形内の位置を指定することで時間とY軸の値を表示できます。ThorImageLSと同様に、取得できるデータセットの大きさは、保存先として選択されたハードドライブのサイズにのみ制限されます。ThorSyncのデータは、ほとんどのデータ解析パッケージで容易にインポートできる一般的なHDF5形式で保存されます。

Execute MATLAB Scripts and ImageJ Macros Directly from ThorImageLS
Click to Enlarge

MATLABスクリプトは、ThorImageLSソフトウェアから直接実行できます。
Open Acquired Images Directly in Fiji/ImageJ or MATLAB
Click to Enlarge

ThorImageLSで取得した画像セットをImageJで開くことが可能。

サードパーティソフトウェアとの統合による自動取得および解析

ThorImageLSでデータ取得から解析までを自動化するには様々な方法があり、ThorImageLSを単独で使用することもサードパーティのソフトウェアやコードと連携させることもできます。

ThorImageLSのスクリプト
画像取得の設定とコマンドのシーケンスは、スクリプト作成エリアに直接ドラッグ&ドロップすることで作成できます。このインターフェイスによりプログラミングの深い知識は必要ありません。また、ImageJのマクロおよびMATLABのスクリプトは、スクリプトエリアからスクリプトコマンドで直接実行できます。スクリプトはXMLファイルとしてエクスポートでき、別のユーザやワークステーションとシェアできます。

サードパーティとの統合
当社のソフトウェアは、MATLABおよびFiji/ImageJを用いて画像取得と解析の自動化を容易に行うことができます。取得したデータセットは、ThorImageLSソフトウェア内のquick connectボタンを使用して、MATLABまたはFiji/ImageJで直接開くことができます。このソフトウェアでMATLABスクリプトとFiji/ImageJマクロを直接実行することもできます。

データエクスポートの特徴
画像データおよび補助データは一般的なファイル形式で保存されるため、他のソフトウェアとの統合化が容易です。画像はメタデータに保存された校正値と一緒に16ビットのTIFFまたはRAWファイルとして保存されます。補助機器および実験条件の設定内容はXML形式で保存されます。ThorSyncと関心領域の統計データはHDF5フォーマットで保存されます。

ソフトウェア開発キット(SDK)
ThorImageLSには、お手持ちのデバイス用プラグインのコードを作成するためのオープンソースSDKがございます。「オープンソース」タブ内のフォームで当社にご連絡いただければ、SDKやソフトウェアの全コードにアクセスすることができます。

ThorImage®LS用コードへのアクセス

研究コミュニティのニーズにお応えして、ThorImageLSおよびそのアドオンのThorSyncはオープンソースとし、対応する当社の顕微鏡システムに付属しています。プログラムはMicrosoft C#およびC++で書かれており、お客様のニーズに合わせてフルカスタマイズすることが可能です。当社のソフトウェアについては長期にわたるサポートをご提供しております。製品の詳細情報、あるいはGitLabにアクセスして最新のThorImageLS(バージョン3.1)やThorSyncソフトウェアのソースコードをダウンロードする方法については、以下の様式で当社までお問い合わせください。お客様からのご提案やバグに関するレポートもお待ちしております。ThorImageLSバージョン3.0およびそれ以降のバージョンは、バージョン2.xおよび 1.xに比べて大幅に新機能が追加されているため、バージョン3.0およびそれ以降のバージョンは当社の旧モデルの顕微鏡には対応しておりませんのでご注意ください。当社では旧モデルをお持ちのお客様のために旧バージョンのソフトウェアのサポートを継続しております。

ThorImageLSおよびThorSyncと統合して作られたコードの一例として、ユーザによって開発されたThorViewer GUIをご覧ください。こういったことも当社のオープンソースコードを利用することで可能になります。スクリプト、あるいはMATLABやImageJのようなサードパーティのソフトウェアを用いてThorImageLSの操作を自動化する方法については、「インターオペラビリティ」のタブをご覧ください。

* お名前:
Required
* Company / Institution:
Required
* Thorlabs Microscope System:
Required
* Email:
Required
Phone:
Preferred Method of Contact : Email or   Phone
Please enter details about your imaging application, operating system and microscope information, or questions you’d like to discuss here:
*  必須項目

大文字/小文字の区別をしています

ThorImage®LS Version 3.1 Specifications
Compatibility
Thorlabs MicroscopesBergamo® (Upright & Rotating) Multiphoton Systems
Thorlabs' Confocal Systems
Cerna® Hyperspectral System
Supplementary Hardware
Thorlabs' Scientific CCD Cameras
Tiberius® Tunable Femtosecond Ti:Sapphire Laser
Coherent and Spectra Physics fs Lasers
DPSS Lasers Molecular UV Uncaging Lasers
KURIOS® Liquid Crystal Tunable Bandpass Filter
Thorlabs' LED Drivers
Cerna® Epi-Illuminator Modules (Item #'s CSE2100 & CSE2200)
High-Power Plasma Light Sources
Piezo Objective Scanner (Item # PFM450E)
Thorlabs' PMTs (Item #'s PMTSS, PMT1001(/M), PMT1002, PMT2101(/M), PMT2102, PMTSS2, & PMTSS2-SCM)
Thorlabs' Si and InGaAs Avalanche Photodetectors
Rigid Stand Translation Stages (Item #'s PLS-X & PLS-XY)
Motorized Microscopy Stages (Item #'s LPS710E(/M), MLS203-1 & MZS500-E)
Cerna® Microscope Body Translator (Item # MMP-2XY)
Cerna® Motorized Focus Modules (Item #'s ZFM2020 & ZFM2030)
Cerna® Motorized Translating Platform (Item # PMP-2XY(/M))
Motorized Pinhole Wheel (Item # MPH16)
Imaging ModalitiesLaser ScanningMultiphoton Imaging: Second Harmonic Generation (SHG) / Two-Photon Fluorescence & Third Harmonic Generation (THG) / Three-Photon Fluorescence
Confocal
Differential Interference Contrast (DIC)
Dodt Gradient Contrast
Fluorescence
WidefieldEpi-Fluorescence
Brightfield
Reflected Light
Hyperspectral
Differential Interference Contrast (DIC)
Dodt Gradient Contrast
Phase Contrast
Darkfield
ApplicationsPhotostimulationSimultaneous Multi-Point with Spatial Light Modulator
Sequential Multi-Point with Galvo-Galvo Scanner
Full Field
Protein Uncaging
Electrophysiology Signaling
Fast Deep-Tissue Scanning
Operating SystemMicrosoft® Windows 7 (64-Bit)
Software Capabilities
AcquisitionHigh-Speed
  • Frame Rates up to 400 fps
  • Series Data Limited Only by the Capacity of the Hard Drive
  • Synchronization Options
    • Start Triggers
    • Stimulus Triggers
  • Coordinated ROI Masking and Analysis
  • Access to Image Data by Third-Party Applications While the Experiment is Active
Time-Lapse
  • Specify Idle Times up to Hours Between Captures
  • Synchronize with Shutter Hardware to Avoid Photobleaching
  • Synchronization Options
    • Trigger First
    • Trigger Each
3D Physiological Scans
  • Piezo or Stepper Motor Control
  • Step Sizes Down to 100 nm
  • User-Defined Laser Power Ramping in Z
Large-Area Mosaic Tiling
  • Image Areas up to the Full Travel Range of the XY Stage
  • Multiplex with Time Series and Z-Stacks
  • Join, Overlay, or Space Tiles to Aid Analysis and Post-Processing
  • Enable Tilt Adjustment to Correct for Samples Not Orthogonal to the Objective
Multi-Modality
  • Simultaneously Obtain Laser-Scanned Images Co-Registered with Widefield Images
  • Acquire External Camera Data Synced with Microscopy Image Data to Correlate Image Features with Specimen Behavior
  • Quickly Switch Between Modalities to Reduce Wait Times over a Single Run
ThorSync™
  • Create Output Signals to Trigger Image Acquisition, Experiment Stimulation, and Auxiliary Equipment
    • 16 Input Analog Channels and 32 Digital TTL I/O Channels
    • 16 Bit Analog Resolution Over ±10 V
    • 2 MHz Digital Signal Resolution
  • Data Stored in Non-Proprietary HDF5 Format
  • Script for Iterative or Custom Acquisition Protocols
  • Customize Display Settings to Improve Signal Interpretation
  • View Signal Statistics upon Rollover
  • Measure Time and Y-Axis Values Using Location Indicators
  • Create or Respond to Signals from Behavioral Devices
Supplementary Hardware
Feature Integration
  • Rapid Excitation Wavelength Switching with Tiberius®
  • Hyperspectral and Multispectral Imaging with KURIOS®
  • Simultaneously Photoactivate Hundreds of Cells in User-Defined Groups using Spatial Light Modulator
  • Control Beam Width Using Spatial Light Modulator
AnalysisRatiometric Acquisition / Calculations
  • Simultaneous Capture of up to Four Channels
  • Define up to 65,535 Regions of Interest (ROIs)
  • Plot Statistics of ROIs Live or After Acquisition
  • Create Custom Equations for Statistics, Such as Ratios and Subtractions
SettingsWorkspace
  • Multi-Column Customizable Workspace
  • Multi-User Settings Saved for Shared Workstations
  • Switch Modality-Specific Settings Quickly to Reduce Wait Times
File Export
  • Images Stored as 16-Bit TIFFs
  • Image Calibration Values Stored in TIFF Metadata
  • OME-TIFF Header Support for Multi-Image Experiments
  • Additional Instrument and Experiment Info Stored in Open XML Format
  • ROI Statistics Stored in HDF5 Data File
Third-Party Integration
  • Launch and Immediately Open Files in Supported 3rd Party Applications using a Quick Connect Button
  • Simplify Hardware Integration through 3rd Party Scripts
  • Create ThorImageLS Scripts that Execute Fiji/ImageJ and MATLAB Scripts Synchronously or Asynchronously
  • Open SDK Enables Users to Code Their Own Device Plugins
SupportOpen-Source
  • Software Code Hosted on GitLab
  • Freely Available with a Thorlabs Microscope Purchase
Technical Support
  • Free Lifetime Software Technical Support
  • Multiple Software Updates per Calendar Year with Feature Updates and Bug Fixes

Selected Publications Using ThorImage®LS

2017

 

Schnell B, Ros IG, and Dickinson MH. "A Descending Neuron Correlated with the Rapid Steering Maneuvers of Flying Drosophila." Current Biology. 2017 Apr 24; 27 (8): 1200-1205.

Strobl MJ, Freeman D, Patel J, Poulsen R, Wendler CC, Rivkees SA, and Coleman JE. "Opposing Effects of Maternal Hypo- and Hyperthyroidism on the Stability of Thalamocortical Synapses in the Visual Cortex of Adult Offspring." Cereb Cortex. 2017 May 1, 27 (5): 3015-3027.

Micu I, Brideau C, Lu L, and Stys PK. "Effects of laser polarization on responses of the fluorescent Ca2+ indicator X-Rhod-1 in neurons and myelin." Neurophotonics. 2017 Jun 5; 4 (2): 025002.

2016

 

Mongeon R, Venkatachalam V, and Yellen G. "Cytosolic NADH-NAD+ Redox Visualized in Brain Slices by Two-Photon Fluorescence Lifetime Biosensor Imaging." Antioxid Redox Signal. 2016 Oct 1; 25 (10): 553-563.

Monai H, Ohkura M, Tanaka M, Oe Y, Konno A, Hirai H, Mikoshiba K, Itohara S, Nakai J, Iwai Y, and Hirase H. "Calcium imaginq reveals glial involvement in transcranial direct current stimulation-induced plasticity in mouse brain." Nat Comm. 2016 Mar 22; 7 (11100): 1-10.

Toni LD, Garoll A, Menegazzo M, Magagna S, Nisio AD, Šabovic I, Rocca MS, Scattolini V, Filippi A, and Foresta C. "Heat Sensing Receptor TRPV1 Is a Mediator of Thermotaxis in Human Spermatozoa." PLoS One. 2016 Dec 16; 11 (12): e0167622.

Scattolini V, Luni C, Zambon A, Galvanin S, Gagliano O, Ciubotaru CD, Avogaro A, Mammano F, Elvassore N, and Fadini GP. "Simvastatin Rapidly and Reversibly Inhibits Insulin Secretion in Intact Single-Islet Cultures." Diabetes Ther. 2016 Nov 9; 7 (4): 679-693.

Lewin AE, Vicini S, Richardson J, Dretchen KL, Gillis RA, and Sahibzada N. "Optogenetic and pharmacological evidence that somatostatin-GABA neurons are important regulators of parasympathetic outflow to the stomach." J Physiol. 2016 May 15; 594 (10): 2661-2679.

Zuo S, Hughes M, and Yang GZ. "Novel Balloon Surface Scanning Device for Intraoperative Breast Endomicroscopy." Ann. Biomed. Eng. 2016 Jul; 44 (7): 2313-2326.

2015

 

Jia Y, Zhang S, Miao L, Wang J, Jin Z, Gu B, Duan Z, Zhao Z, Ma S, Zhang W, and Li Z. "Activation of platelet protease-activated receptor-1 induces epithelial-mesenchymal transition and chemotaxis of colon cancer cell line SW620." Oncol Rep. 2015 Jun; 33 (6): 2681-2688.

Lu W, Tang Y, Zhang Z, Zhang X, Yao Y, Fu C, Wang X, and Ma G. "Inhibiting the mobilization of Ly6Chigh monocytes after acute myocardial infarction enhances the efficiency of mesenchymal stromal cell transplantation and curbs myocardial remodeling." Am J Transl Res. 2015 Mar 15; 7 (3): 587-597.

Lang X, Spousta M, Hwang YJ, and Lyubovitsky JG. "Noninvasive imaging of embryonic stem cell cultures by multiphoton microscopy reveals the significance of collagen hydrogel preparation parameters." Analytical Methods. 2015 10 Nov; 8: 280-294.

Lu w, Xie Z, Tang Y, Bai L, Yao Y, Fu C, and Ma G. "Photoluminescent Mesoporous Silicon Nanoparticles with siCCR2 Improve the Effects of Mesenchymal Stromal Cell Transplantation after Acute Myocardial Infarction." Theranostics. 2015 Jun 25; 5 (10): 1068-1082.

Dechen K, Richards CD, Lye JC, Hwang JE, and Burke R. "Compartmentalized zinc deficiency and toxicities caused by ZnT and Zip gene over expression result in specific phenotypes in Drosophila." Intl. J. Biochem. Cell Biol. 2015 Mar; 60: 23-33.

2014

 

Partridge JG, Lewin AE, Yasko JR, and Vicini S. "Contrasting actions of group I metabotropic glutamate receptors in distinct mouse striatal neurones." J Physiol. 2014 Jul 1; 592 (Pt 13): 2721-2733.

Cai F, Yu J, Qian J, Wang Y, Chen Z, Huang J, Ye Z, and He, S. "Use of tunable second-harmonic signal from KNbO3 nanoneedles to find optimal wavelength for deep-tissue imaging." Laser & Photon Rev. 2014; 8: 865-874.

Qin X, Qiu C, and Zhao L. "Maslinic acid protects vascular smooth muscle cells from oxidative stress through Akt/Nrf2/HO-1 pathway." Mol. & Cell. Biochem. 2014 Feb 20; 390 (1-2): 61-67.

Lang X and Lyubovitsky JG. "Structural dependency of collagen fibers on ion types revealed by in situ second harmonic generation (SHG) imaging method." Analytical Methods. 2014 Nov 13; 7: 1680-1690.

Poguzhelskaya E, Artamonov D, Bolshakova A, Vlasova O, Bezprozvanny I. "Simplified method to perform CLARITY imaging." Mol. Neurodegener. 2014 May 26; 26: 19.

Liu J, Wu N, Ma L, Liu M, Liu G, Zhan Y, Lin X. "Oleanolic Acid Suppresses Aerobic Glycolysis in Cancer Cells by Switching Pyruvate Kinase Type M Isoforms." PLoS One. 2014 Mar 13; 9 (3): e91606.

2013

 

Xiang H, Cuifang K, Zhaotai G, Shuai L, Yanghui L, Xu Liu. "Contrast reversal confocal microscopy." Optics Comm. 2013 Jul 1; 298-299: 272-275.

Takata N, Nagai T, Ozawa K, Oe Y, Mikoshiba K, and Hirase H. "Cerebral blood flow modulation by Basal forebrain or whisker stimulation can occur independently of large cytosolic Ca2+ signaling in astrocytes." PLoS One. 2013 Jun 13; 8 (6): e66525.

Brown CM, Melcher JT, and Stranick SJ. "Scan Linearization for Resonant Optomechanical Systems." Imaging & Appl. Optics. 2014; IM1C.3.

Lalchandani RR, van der Goes MS, Partridge JG, Vicini S. "Dopamine D2 receptors regulate collateral inhibition between striatal medium spiny neurons." J. Neurosci. 2013 Aug 28; 33 (35): 14075-14086.

当社の顕微鏡とThorImageLSを用いて取得された画像

ThorImage®LSの新機能

下の表内のリンクをクリックすると、ThorImageLSの最新バージョンや以前のバージョンのアップデートや変更に関する情報をご覧いただけます。

Quick Links
ThorImageLS VersionRelease Date
3.1November 3, 2017
3.0October 13, 2016
2.4March 1, 2016
2.3March 9, 2017
2.2December 8, 2014
2.1September 10, 2014
1.5October 30, 2013

 

Version 3.1 - November 3, 2017

New Hardware Support
  • Added Support for Thorlabs' Scientific Monochrome CCD Cameras
    • Allows Imaging With Supported Cameras
  • Added Support for Spectra-Physics® Insight Dual Port Laser
  • Added Support for Coherent® Discovery Dual Port Laser
  • Added Support for Thorlabs' Tiberius® Femtosecond Ti:Sapphire Laser
    • Allows for Fast Sequence Capture
  • Added Support for Thorlabs' Hyperspectral Imaging System
    • Allows Capture of a Hyperspectral Sequential Image Stack
  • Added Support for Spatial Light Modulator (SLM) Photoactivation
    • Allows for Calibration and User Interface for ROI Generated Patterns
    • Includes Additional Digital Outputs for Galvo-Galvo Scanner
  • Added Support for Thorlabs' Beam Stabilizer
  • Added Support for External USB National Instruments™ Cards (USB-6363 and USB-6341)
  • Added Support for Two Additional Digital Shutters (Configured Similarly as Previous ThorShutterDig)
New Features
  • Added Disconnect State for Available Devices Not to be Controlled by ThorImageLS
  • Added Multiple Modalities
    • Allows User to Configure and Switch Between Different Imaging Modalities Easily
  • Added Digital Offset Capability for PMT2000
    • Adjustment Allows for Same Dynamic Range Between Galvo-Resonant and Galvo-Galvo Scanners
  • Added Pockels Cell Digital Output for Galvo-Resonant Scanner
    • Includes Output of Digital Line During Bleaching and Image Acquisition
    • Similar to Previous Galvo-Galvo Functionality
  • Added Pockels Cell Digital Output to be Active During Image Acquisition for Galvo-Galvo Scanner (Previously Only Available During Bleaching)
  • Added Configurable Software Buttons to Control National Instruments™ Digitial PFI lines
  • Added Focus Tilt Adjustment for Tile Capture
    • Allows User to Configure 3 Point Focus Plane to be Used During Capture
    • Ensures Focus Across All Tiles
  • Added Ability to Set the Pockels Cell Power Mapping to Linear
  • Added Option to Turn Off Pockels Cell Blanking at 0% for Galvo-Galvo
  • Added Pockels Cell Phase Shift Setting to Galvo-Galvo (Previously Only Available for Galvo-Resonant)
  • Added Ability to Configure Min and Max Field Size for Scanners
  • Added PMTSelection for Simultaneous Bleach Imaging
    • Allows Users to Select PMT to be Used for Simultaneous Bleach Imaging
  • Added Improved Hardware Triggering to Start Acquisition
  • Added Linearization Table for MCLS Laser
  • Added Estimated Bleach Duration for Each Bleaching ROI
    • Located in Bleach Setup
User Interface (UI) Improvements
  • Added Quick Access Icon for Hardware Settings Window
  • Enhanced Displayed Device Feature
    • Allows User to Configure Which Devices are Displayed in Hardware Setup
  • Added PMT Polarity Option to the UI Under the PMT More Panel
  • Added Search Capability When Editing Application and Device Settings
  • Added Display of Bergamo® Rotation Value in Secondary Z Panel (Value Saved in Experiment.xml)
  • Added Pockels Cell Minimum Power Indicator on Pockels Cell Slider
    • Gives Indication if Pockels Cell is Operating Below Recommended Minimum Power
  • Added Ability to Control a Fourth Pockels Cell Cell for Galvo-Galvo Configurations
  • Added Custom Configuration of Pixel Density List
  • Added Center Bleach Scanner and Pockels Cell Power Control to Bleach Panel
  • Added 'Do Not Show' Message to 'Fij' (ImageJ) Install Location Message
  • Enhanced ROI Calculations
    • Note: Changed Calculations May be Slightly Different From Previous Versions, up to 3 Decimal Places
Fixed Bugs
  • Fixed - Pockels Cell Digital Output Not Going Low for Single Point Bleach
  • Fixed - Delete Experiment Raw File if Capture is Stopped Before First Trigger Arrives
  • Fixed - 3D View Not Working Correctly in Image Review for Tiled Experiments
  • Fixed - ROI Chart, Stats Table and Line Profile View Settings Get Deselected When Deleting All ROIs
  • Fixed - Field Size Setting Issue With Galvo-Galvo When Using the Up and Down Zoom Buttons
  • Fixed - Time Series Trigger First Acting Like Trigger for Tiling Experiments
  • Fixed - Streaming Capture Freezes When Using Histogram Controls
  • Fixed - Last Digit in Negative Z Limit Value Cut Off in Z Control Panel
  • Fixed - Z Position Unit Incorrect (Displays mm Instead of µm)
  • Fixed - Incorrect High Voltage Range for PMT1002 (Can Now be Set to 1.1 V)
  • Fixed - Application Fault Switching to Capture Tab if Bleaching Power is Non-Whole Number
  • Fixed - In ThorSync, Limit Time to Acquire Data of 14 Minutes When Using Specific Time Duration
  • Fixed - Issues With SLM Calibration (Cannot Run SLM Calibration Routine Directly After Galvo-Galvo Calibration)
  • Fixed - Possible Communication Loss to PMT2100 Devices 

 

Version 3.0 - October 13, 2016

New Features
  • Added Support for DDR05 Fast Power Control Device
    • Allows for Faster Power Ramping Acquisitions
  • Added Support for Spectra-Physics® Mai Tai Laser
  • Added Support for Entry Level Galvo-Galvo Confocal System (Previously Separate Digital Acquisition Board Necessary)
  • Added Fine Two-Way Calibration
    • Allows for Less Two-Way Adjustment When Changing Field Sizes
  • Added Ability to Save Galvo-Galvo Offset and Scale Values to ThorConfocalGalvoSettings.xml File
  • Added Option to Save .tiff Files Compressed or Uncompressed
  • Added Option to Save Only Enabled Channels as Raw
  • Added Ability to Save Snapshot Image, Either as Single Image or as Experiment
  • Added Ability for Multi-Location Imaging on Platforms With Supporting Stages (Bergamo, MCM3000 Series and MLS Stage)
    • Includes New UI for Defining and Navigating Multi-Location Regions
    • Capability to Invert Scanners (Flip Horizontal and Vertical) for Galvo-Resonant and Galvo-Galvo Systems
    • Capability to Invert Stage Directions for Bergamo, MCM3000 and MLS Devices
  • Added Ability to Use ROI Mask (ROIMask.raw) as Pockels Cell Mask
    • Includes Updating Mask in UI
  • Added Ability to use Pockels Cell Power Ramping During Fast Z Acquisitions
  • Added High Temporal Resolution Image Capture Spacing
    • Allows to Set Delay Between Frame Acquisitions
  • Added Ability to Sequentially Capture Images Using Different Hardware Settings Such as Channel, PMT, Laser and Power
  • Added Ability for MCLS Laser Calibration to Linearize Power Output
  • Added Support for Secondary Z Panel
  • Added Offset Control Support for PMT2000 Devices
  • Added Ability to Image and Bleach Simultaneously
  • Added Option to Save Bleach Images in Raw Format
  • Added Ability to Turn off Monitor When Starting Experiment Capture
  • Added Ability to Synchronize the Start and Stop of ThorSync With Start and Stop of ThorImageLS Capture
  • Added Orthogonal View Functionality for Z Stack Acquisitions in Image Review
  • Added New Script Commands to Move X, Y and Z Motors Between Script Acquisition
Fixed Bugs
  • Fixed - Bleaching Capture Fields from Being Editable During Capture
  • Fixed - Raw Image Review Does Not Support 3D Display
  • Fixed - Incorrect PMT3 and PMT4 Voltage Range Setting Saved in Template is Not Used When Running Script
  • Fixed - Galvo-Galvo Line Scan Can Set Y Scale Incorrectly When Changing X Scale
  • Fixed - Galvo-Galvo Snapshot Appears to Lock Up With Large Pixel Density Setting and Dwell Time
    • Added Abort Button
  • Fixed - Standard Sensitivity PMTs Not Set to 0 When Display Indicates 0 After Hardware Reset
  • Fixed - 4 Channel Snap-Shot Image is Saved as RGB (Now Saved as Multi-Page Image)
  • Fixed - Pockels Cell Waveform Can be Out of Phase Across Image
    • Added Adjustable Phase Shift Parameter to Correct
  • Fixed - Selecting Certain .xml Files in Settings Editor Takes a Long Time and Appears Application is Locked Up
    • Removed Unnecessary Files from List
User Interface (UI) Improvements
  • Changed Layout for Hardware Setup Window
  • Added Mouse Scrolling in Settings Editor
  • Removed Unnecessary .xml Files in Settings Editor View
  • Moved Center Scanners and Resonance Scanner Always on Functionality to Area Control Advanced Panel in Capture Setup
  • Added Second Column Option for Capture Setup Display
  • Moved Field Size Entry to Under Scan Area Cartoon
  • Added Dropdown List for Most Popular Pixel Density Settings
  • Added +/- Buttons for Galvo-Galvo Angle Control
  • Changed Z Slider Bar to Objective Graphical
  • Replaced Coarse/Fine Buttons With Increase/Decrease Buttons
  • Changed Z units from mm (millimeter) to µm (microns)
  • Added Visibility Option for "Set Zero" Feature in XY and Z Panels
  • Added Visibility for Invert Option in Z Control Panel
  • Added Visibility Option Individual Light Path Controls
  • Renamed Coherent® Control Panel to Multiphoton Laser Control
  • Display Summary and Status for Collapsed Panels in Capture Setup
  • Added features to Histogram Control Such as:
    • Black and White Point Fields
    • Connector Between Black and White Point Fields to Help Locate Mid-Point
    • Ability to Enlarge Single or all Histograms
    • Log Scale Display Option
  • Stats Chart and Stats Window Changes
    • Change How They are Displayed (Selecting to Close the Window No Deselects Visibility)
    • Added Ability to Save Chart as .jpg
    • Added Ability to Save Table Data as .csv, .txt or .raw
    • Change Chart Y Scale toScientific Notation
    • Set Chart X Axis Limit to Range of Data
  • Added Display Option for Line Profile Window
    • Color Settings Changes
  • Added More LUT Colors (BlueStat, CyanHot, GrayStat, GreenStat and RedStat)
  • Allow Same LUT for Multiple Colors
  • Enhanced Display of Min and Max When Viewing Gray Scale of Single Image Feature
  • Eliminated Zoom Level Edit Dialog and Replaced With User Entered Zoom FIeld
  • Changed Experiment Naming by Adding Separate Iteration field
  • Added Dialog to Suppress "File Name Exists" Prompt
  • Changed Browsers to More Useful Interface
  • Removed Intermediate Menu When Selecting Image Review
  • Saving More Experiment Information Such as Galvo-Galvo Angle Value and Pinhole Size
  • Z stack Experiments Open Z Slider to Mid-Range
  • Added Z and T Unit Display for Z and T index
  • Image Review Play is Now in Continuous Loop Until Manually Stopped
  • Changed Galvo-Galvo Pixel Dwell Time Scale Bar to Single Bar

 

Version 2.4 - March 1, 2016

New Features
  • Added Support for USB Controlled Compact PMTs (PMT2100)
  • Added Ability to Scan User Drawn Square, Rectangle, Kymograph, Line and Polyline ROIs (Line and Polyline Scanning Requires Galvo-Galvo Scan System)
  • Added Ability to Scan ROIs at Any Angle (Requires Galvo-Galvo Scan System)
  • Added Software Support for Thorlabs Variable Beam Expander and Power Attenuator
  • Added New Logic for Linearization for ThorPowerControl
  • Added Ability to Open Multiple Experiment Review Windows 
  • Added Ability to Review Experiments Saved in Raw Image Format
  • Added User Defined Hotkey Shortcuts for Popular Commands Such as Start/Stop Scan, Stage Motion (X,Y and Z) and Power Control
  • Added Ability for User to Define Experiment Notes
  • Added Nyquist Calculator for Defining Optimal Scan Settings
  • Added Scale Bar Option to Display Length (µm) for Line and Polyline ROIs
  • Added Configurable Digital Pulse Output Upon Completion of Saving Image Frames to Disk
  • Added Configurable Digital Output during Capture Active to Synchronize With Other Equipment
    • Normal or Inverted
  • Added Time, Pixel Size and Frame Rate Metadata Now Stored With Experiment File and Displayed in Experiment Review Info Panel
  • Added Galvo-Galvo Pockels Cell Setting to Keep Pockels Cell at Power When Capture Complete (ParkAtMinimum) Similar to Galvo-Resonant Setting
  • Added Support for Tiberius Femtosecond Ti:Sapphire Laser
  • Added UI Enhancements
    • Histogram Up/Down Buttons in Addition to Slider Control
    • Additional Configurable Wavelength Selections for Coherent® Laser Control Panel (Increase from 4 to 8)
    • Tile Position Indicator in XY Map
    • Abililty to Resize ROIs
    • Using Shift Key When Drawing ROIs Forces Shapes to be Square, Circle or Vertical and Horizontal
    • Display Status/State of Collapsed Control Panels (Helps to Reduce Scrolling Curing Setup Process)
    • Added Reset Button for Control Panel Visibility
    • Added Current Power Level Display for Pockel Cells and Power Regulator During Capture of Experiment
    • Increased Experiment Settings Browser Width
    • Added Message Indicating When Max Number of Frames is Exceeded
Fixed Bugs
  • Fixed - Display of Calculated Capture Rate, Time to Complete and Estimated Time in Capture Panel
  • Fixed - X-Axis Motion When Switching Tabs
  • Fixed - Mismatch of Z Parameters Between Capture Setup and Capture Tabs
  • Fixed - "Set Zero" Feature With MCM3000 Series With LNR Stage
  • Fixed - Compatibility Issue With Previous Versions
    • Separate ThorImageLS2.4 User Folders
  • Fixed - Bleaching Preview Crash
  • Fixed - Issue With "Field from ROI" Not Using Pixel Aspect Ratio
  • Fixed - Application Fault During Manual Setup of Power Ramp Definition
  • Fixed - Issues With Application Pause at Second Post Bleach Acquisition During Galvo-Galvo Bleach Capture
  • Fixed - Issue Importing Settings from Other Instruments
  • Fixed - Application Fault if Daughter Window Positions are Saved as Non-Integer
  • Fixed - Application Fault When Selecting Center Scanner if Pockels Cell Calibration Set to 0 for Min and Max
  • Fixed - Pockels Cell Waveform for First Line of First Frame for Galvo-Galvo Scan
  • Fixed - Incorrect Dwell Time Used During Galvo-Galvo Scripting
  • Fixed - Galvo Issue Not Parked After Closing Application
  • Fixed - ThorPowerControl Setting to Zero When Switching Application Tabs
  • Fixed - Application Fault When Using Pixel Density Slider in Combination With Mouse Click
  • Fixed - Display Issue With Data Histograms in Capture
  • Fixed - Collapse of Device all Panels When Selecting "More" Option in Scanner Panel if Multi-Panel Access Option Not Selected
  • Fixed - VBE Max Value Not Saved Correctly
  • Fixed - Application Fault With Grid Capture Using MLS Stage

 

Version 2.3 - March 9, 2015

New Features
  • Added Ability to Generate High Zoom Image of an ROI Area
  • Added Additional Color LUT Options Such as Rainbow, Fire and Yellow Hot (for 2D and 3D Images)
  • Added Z Position Display During Capture
  • Added Circle and Oval ROI Shapes
  • Added User defined Arithmetic Measurements for ROIs
  • Added PMT On/Off Status and Voltage Display in UI
  • Added Additional Bleaching Features (Bleaching per Point of ROI Shapes, Added Bleaching Fill for ROIs, Added Bleaching FIll Types of Raster and Tornado for Rectangles)
  • Added Additional Features for ROI Stats Chart and Table (Display or Hide Cursor Statistics, Display or Hide Table or Chart, Pan Option for Navigating Chart)
  • Added X and Y Home Location in XY Control Panel
  • Added Saved Bergamo Rotation Value in Experiment.xml File
  • Changed Stimulus Mode Functionality
  • Added True Line Scan Functionality (Renamed Existing Line Scan to Kymograph)
  • Added Wait Feature to Scripting Functionality
  • Added Support for New Variable Beam Expander
Fixed Bugs
  • Fixed - Issue With Pockels Cell Blanking At Edge Of Image When Using Two-Way Scan Mode
  • Fixed - Issue With Fast Z if End Point Is Set to 0
  • Fixed - Issue With Clearing Fast Z Waveform if Experiment Is Stopped Before Completion
  • Fixed - Issue With Incorrect Number of Time Frames Displayed When Opening Fast Z Experiment With ImageJ
  • Fixed - Issue With Total Time Not Updating With Streaming Capture if Fast Z Option Is Seleced And Deselected
  • Fixed - Issue With Streaming Capture Dropping Frames if Image Size is 2048x2048 and Acquiring Multiple Channels
  • Fixed - Issue With Line Scan Displaying a Y Offset When "Always Centered" is Checked in UI
  • Fixed - Issue With Galvo-Galvo Tripping When Making Frequent Changes to Image Paramaters (i.e. Zoom Level, Field Size, Dwell Time and Averaging Mode)
  • Fixed - Issue With Resonance Scanning Not Turning Off if Initial Hardware Setup Window Closed Using the Windows Close Button
  • Fixed - Issue With Bleaching in Wrong Location if the "Flip" Option is Not Used
  • Fixed - Issue With Galv / Galvo System Crash When Increasing Zoom and at 80x
  • Fixed - Issue With Backscan Line Appearing at Top of Galvo-Resonant Scan Image
  • Fixed - Issue With Saving a Movie to Existing .Avi and It Open
  • Fixed - Issue With Pockels Cell Waveform Spike if Calibration Range Start Below 0

 

Version 2.2 - December 8, 2014

New Features
  • Added Capability for Adding Multiple ROIs With Statistics
  • Added Capability for Multi-Point Bleaching (Requires Galvo-Galvo Scanner)
  • Added Real-Time ROI Statistics Calculations During Capture
  • Added ROI Statics Table and Chart Plotter to Image Review (Post Processing)
  • Added Option for Turning on Resonance Scanner at Software Startup
  • Added Feature to Set X and Y Stage Positions to "0" Similar to Z Function
  • Added Feature to Select Which Z Position Image is Displayed During Fast Z Imaging
  • Added Capability to Increase Frame Rate Capture to 8 fps (Default is 4 fps and Does Not Work)
Fixed Bugs
  • Fixed - Negative Value for Galvo-Galvo Two Way Offset Shifts Image Incorrectly
  • Fixed - Y Offset for Galo/Resonance Line Mode is Always 0 Volts
  • Fixed - ThorImageLS Crash if Window's OS "User Folder" Path Points to Network Location
  • Fixed - ThorImageLS Crash if Enter a Value of Greater Than 255 for Field Size
  • Fixed - Galvo-Resonant Line Scan Not Working if Pockels Cell is Configured
  • Fixed - Tool Tip for Galvo-Galvo Slow and Fast Dwell Time Buttons Are Incorrect
  • Fixed - Pockels Cell Not Working Correctly for Galvo-Galvo if Dwell Time ≤ 1µs
  • Fixed - Galvo-Galvo Trigger First Feature Not Functional for Time Series
  • Fixed - Can't Enter a Negative Value in Pockels Cell Calibration Min Value Field
  • Fixed - Galvo-Galvo Detector Polarity Setting Not Reading from Correct Settings File

 

Version 2.1 - September 10, 2014

New Features
  • Added Control for Multiple Pockels Cell and Simultaneous Power
  • Added Power Feedback Capability for Pockels Cell
  • Added Interface for New MCM3000 Controller
  • Added Visual Indication of if X, Y or Z Position is Out of Range in Capture Setup
  • Added Support for Mixed Polarity Detectors
  • Added Interface for Scanimage to Control the Lightpath Elements on Bergamo II
  • Added Saving of Z Stage Invert Option
  • Added 16X Objective to Objective List
Fixed Bugs
  • Fixed - Field Size Square in Cartoon GUI Not Centered When It Should Be
  • Fixed - Channel D Not Seen in Line ROI Under Certain Circumstances
  • Fixed - Maximum Image Size Doesn't Update When Changed to and from Color Mode
  • Fixed - MCLS Laser Power is Not Adjusting Correctly When Using Adjust Power +/- Buttons
  • Fixed - ThorImagels Startup Window is Bright
  • Fixed - Bergamo Not Moving to 0 When it is the First Command
  • Fixed - Line Profile Window Does Not Reappear in the Same Location
  • Fixed - Task for Fast Z Continues After the Experiment is Stopper
  • Fixed - Height Remains Constant in the [Um] Units When Using Rectangle Mode
  • Fixed - Bergamo Z Axis Still Moving After Stopping Preview
  • Fixed - First Live Preview Generates a Single Channel Image Instead of a 4 Channel Image
  • Fixed - Bergamo Light Path Device Added to Hardware Setup Menu
  • Fixed - Bergamo: User Can "Set Zero" While Z Moving, Causing Z to Go to Unintended Location
  • Fixed - Zstepper and Bergamo Z Axis Can Make Unintended Moves When Outside of Range
  • Fixed - MCLS Laser Power Not Getting Set When Capture Run from Script
  • Fixed - Bergamo: in Scenarios When Trying to Move X or Y Positive Will Prompt for Movement in Z
  • Fixed - X and Y Sliders in Capture Setup Allow to Change Stage Position
  • Fixed - Zstage Reverts Back to Position Before Capture Was Started When Switching Back to Capture Setup
  • Fixed - Refresh Hardware Will Reset Zstage Selection
  • Fixed - Power Ramping With Power Control Device Not Working Correctly (Goes to Stop Power Before Starting Z Stack)
  • Fixed - Single Channel Viewing Will Use Channel A Auto Enhance Settings

 

Version 2.0 - June 20, 2014


New Features
  • Added Streaming Finite Mode With Hardware Trigger for Thorephydata
  • Added Enhanced Experiment Browser Interface
  • Added 'Open Experiment Folder' Button Using Windows Explorer in Experiment Review
  • Added Open Experiment in 'Fiji' (ImageJ) Button in Experiment Review
  • Added Database Interface for Saved Experiments
  • Added Enhanced Channel Selection Operation in Capture Setup
  • Enhanced Stimulus Mode by Changing Max Frames to Time Based Values
  • Added Rotation Tool for 3D Viewing
  • Added Up / Down Indicators for Channels Black/White Points in 3D Viewer
  • Added Persistence to Output Path in 3D Viewer
  • Updated Visibility Attribute for Coarse Panel to Be Collapsed in Applicationsettings.Xml
  • Added Ouptut Path Persistence Between Thorimage Sessions
  • Enhancement to Hide Tile View Icon in Capture Setup Toolbar When XY Panel is Not Enabled in Display Options
  • Added 100% Button to Image Review. Resizes Image to Full Size.
  • Added Enter Key Function for All Text Boxes
  • Enhanced Hardware Triggering for Capture Modes
  • Added Bleaching Control to Display Options

Fixed Bugs
  • Fixed- 3D View Not Resetting to Center When Switching Between Rectangular and Squared View
  • Updated Visibility Attribute for Coarse Panel to Be Collapsed in Applicationsettings.Xml
  • Fixed - Visibility of Time Remaining Value During Stimulus Capture
  • Fixed - UI Grayscale Option Focus
  • Fixed - Incorrect Status of Image Review Playback Button After Switching Tabs
  • Fixed - Trigger Each Issue for Z&T Capture Series
  • Fixed - Issue With First Start of Thorimage. Missing Temp Folder
  • Fixed - Highlight Issue of Z Course Option When First Starting Application
  • Fixed - Visibility of RAM Frames Parameter on First Start of Application
  • Fixed - Visibility Issue of Non-Highlighted Buttons in Area Control and Coherent® Laser Control Panels
  • Fixed - Frames Recorded Under Streaming Stimulus Dictates Number of Frames Under Streaming Finite
  • Fixed - Thorimagels Crash - in 3D Options When Setting Zspacing Multiplier to 0
  • Fixed - Power Control Value Always Displays 28
  • Fixed - Digital Shutter Not Always Opening During Stimulus With and W/O Trigger
  • Updated Ramping to Mode to None for Default
  • Fixed - Ability to Resize Capture Setup Panel Top Section. Set to Fixed Size
  • Fixed - Digi Shutter Not Closing When Manually Stopping Z and T Capture or Finite Capture
  • Fixed - Streaming Stimulus Stopping Before Max Frames Reached
  • Fixed - Tile Capture Not Completing Properly
  • Fixed - Coherent® Chameleon Shutter Gets Out of Sync With Application. Set Shutter Icon to Highlight Close - When Thorimagels Launches
  • Fixed - Enter Key Stopping Live Capture in Capture Setup
  • Fixed - Unresponsive Application When Stopping Capture Before Stimulus Trigger Occurs
  • Fixed - Application Fault in Streaming Stimulus Capture When Trying to Allocate More Disk Space Than is Available
  • Fixed - Allowing Any Character Entered Into XY Control Go Field
  • Fixed - Z Preview Issue if Averaging (Cumulative) Set
  • Fixed - Possible Application Fault When Selecting Cancel in New Browser Window
  • Fixed - Capture Setup Channel Color Labels Change to Wrong Color When Deactivated Inside the Color Image Settings
  • Fixed - Application Fault When Playback of T or Z Slider of Incomplete Experiments
  • Fixed - When in Capture Setup, Selecting Deactivated Colors (With the Check Mark) Will Cause the Default Color to Be Shown
  • Fixed - Triggering Issue of Stimulus Capture After Manual Stop and Start Again
  • Fixed - Possible Application Freeze Stopping Capture
  • Fixed - Windows Culture Not Set to US Issue
  • Fixed - Focus Loss of Capture Setup Tab
  • Fixed - Z Control Preview Bug in Capture Setup

 

Version 1.5 - October 30, 2013


New Features
  • Galvo-Galvo Imaging Support
  • Pockels Cell Logic With Galvo-Galvo
  • Bergamo Communication Support
  • Generation 2 ECU Controller Support
  • Trigger Each Triggering Mode for Z and T Series Experiments
  • Dual Scanner (Galvo-Galvo and Galvo-Resonant) Support (Switchable Via Software Selection)
  • Bleaching, Activation and Uncaging of ROIs Support
  • User Can Save a Copy of Previewed 3D Experiment from the Capture Setup Panel
  • Line Profile Upgraded to Display Multiple Channels Simultaneously
  • Stimulus Streaming Capture Mode
  • Fast Z Acquisition Option for Streaming Modes
  • Zoom Factor for Field Size Adjustment
  • Reticle Overlay

Fixed Bugs
  • Fixed - Progress Indicators Synchronization
  • Fixed - Tiles Preview Captures a Streaming Experiment
  • Fixed - Image Review Movie Does Not Work for All Tile Locations
  • Fixed - Crash When No Detector/Scanner is Connected
  • Fixed - Refresh GUI Panels Immediately After Display Options Have Been Modified
  • Fixed - Show Most Recent Button Not Working at Software Startup
  • Fixed - Allow RAM Buffers to Be Configured from GUI to Prevent Overflow of Captured Buffers
  • Fixed - Prevent Stage from Moving When CaptureSetup Panel is Selected
  • Fixed - Shutter for Each Time Point in Z&T Capture Mode
  • Fixed - Switch Between Grayscale/Color Displays When a Single Color Checkbox is Selected
  • Fixed - Crash When LineScan Mode for Galvo-Resonant is Selected
  • Fixed - Crash When Coherent® Laser Not Properly Configured
  • Fixed - Issue With Experiments Failing to Start Due to MLS Stage Connection
  • Fixed - 3D Rendering Unnecessarily When 2D Selected in ImageReview
  • Fixed - Reset Image Now Move the Image to Top Left in All Cases

Posted Comments:
ji3g4xupaog0  (posted 2018-10-31 02:48:36.977)
您好,我想請問幾個問題。 ThorImage®LS這套軟體,是提供購買您們產品的客戶免費下載的嗎?還是需要另外再購買呢? 官網上介紹的工作區介面,是軟體自帶的嗎?還是用戶必須自己去寫呢? 我們主要是想通過「ThorImage®LS→DAQ→Galvo Scanning System」再去掃描sample,在ThorImage®LS上面顯示galvo scanning system掃描到的成像圖,不知道實際上能不能這樣操作....? 謝謝。
nbayconich  (posted 2018-11-12 12:46:25.0)
Thank you for contacting Thorlabs. At the moment our Thorimage software is only available when included with one of our imaging systems and we do not have a version of the Thorimage software to download separately for DIY projects. Access to the open source project is limited to existing customers looking to customize Thorimage to their needs with Thorlabs microscope. The scanning parts Thorimage is not open source and cannot be customized to function with other scanners and digitizing hardware. If you currently have one of our microscope systems and need a system software reinstall or update please contact us at imagingtechsupport@thorlabs.com.
ログイン  |   マイアカウント  |   Contacts  |   Careers  |   個人情報保護方針  |   ホーム  |   FAQ  |   Site Index
Regional Websites:East Coast US | West Coast US | Europe | Asia | China
Copyright 1999-2019 Thorlabs, Inc.
Sales: +81-3-6915-7701
Tech Supports: +81-3-6915-7701


High Quality Thorlabs Logo 1000px:Save this Image